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Reconstrução da evolução molecular do vírus Usutu na Alemanha

fêmea Mosquito Culex pipiens


O vírus Usutu (USUV) é um flavivírus transmitido por mosquitos que está amplamente distribuído no sul e centro da Europa. Este vírus zoonótico circula principalmente entre aves e mosquitos, mas em casos raros, pode infectar outros mamíferos, incluindo humanos. No passado, o USUV foi associado à mortalidade em massa de aves, especialmente melros e corujas. Na Alemanha, o USUV se espalhou rapidamente desde sua primeira detecção em 2010 em mosquitos, na presença de hospedeiros suscetíveis e espécies vetoras.

Para entender melhor o genoma viral, foram realizadas análises filogenéticas em amostras de aves coletadas de 2017 a 2021 em toda a Alemanha. Essas análises revelaram que duas linhagens do vírus Usutu são predominantes na Alemanha e estão distribuídas por todo o país. Essas linhagens podem ser divididas em subgrupos, indicando uma diversificação genética do vírus. Foi possível demonstrar que o intervalo de tempo entre a detecção das linhagens Usutu nas aves e o ancestral comum mais recente é muito curto, indicando a eficácia dos esforços de vigilância em vigor.
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O vírus Usutu (USUV) é um arbovírus que pertence à família Flaviviridae, gênero Flavivirus. Seu genoma de RNA de fita simples de sentido positivo, de 11.064 nucleotídeos, codifica uma única poliproteína que é clivada por proteases virais e hospedeiras em três proteínas estruturais (C, prM, E) e sete proteínas não estruturais (NS1, NS2a, NS2b, NS3, NS4a, NS4b e NS5). O USUV foi isolado pela primeira vez na Suazilândia, África, em 1959, de um mosquito. O USUV circula em um ciclo enzoótico entre mosquitos como vetores e aves como reservatórios e hospedeiros amplificadores, com mosquitos do complexo Culex pipiens sendo o vetor principal.

Espécies de aves extremamente suscetíveis, como melros (Turdus merula), pardais (Passer domesticus) e aves de rapina, servem como hospedeiros naturais. Até agora, o USUV foi associado principalmente à mortalidade de aves suscetíveis, especialmente melros, em toda a Europa Central.

O vírus também tem potencial zoonótico e pode infectar humanos, em casos raros causando sintomas neurológicos graves. No entanto, os humanos, assim como outras espécies de mamíferos suscetíveis, são considerados hospedeiros sem saída, pois podem ser infectados, mas não conseguem sustentar o ciclo de transmissão. Além disso, o USUV já foi encontrado em cavalos, cães, veados, javalis, morcegos, esquilos e roedores.

A variabilidade genética do USUV foi estudada por meio de análises filogenéticas de sequências parciais dos genes do envelope E e NS5, bem como sequências completas do genoma. Essas análises revelaram a existência de oito linhagens distintas, que se agrupam de acordo com sua origem geográfica: África 1-3 e Europa 1-5. As aves migratórias da África provavelmente introduziram diferentes linhagens de USUV na Europa em momentos independentes, resultando na dispersão de linhagens distintas de USUV. A heterogeneidade genética das linhagens europeias é provavelmente devida à evolução local, enquanto as linhagens africanas são resultado de migrações generalizadas e múltiplas introduções de variantes de vírus de diferentes áreas geográficas de origem. No entanto, a atribuição e a nomenclatura das linhagens/estirpes do USUV não foram padronizadas na literatura, e não foi determinado de forma conclusiva se as diferentes linhagens têm influência na afinidade do hospedeiro e do vetor.
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O vírus Usutu (USUV) tem circulado na Europa e atravessou as fronteiras, incluindo a Alemanha. Inicialmente, os esforços de vigilância de flavivírus na Alemanha se concentraram na detecção de anticorpos contra o vírus do Nilo Ocidental (WNV). No entanto, desde 2009, programas de vigilância molecular em mosquitos e aves foram implementados na Alemanha. O primeiro isolado de USUV foi documentado no sul de Frankfurt em 2010, e várias linhagens de USUV foram subsequentemente detectadas em aves selvagens e em cativeiro, principalmente melros e corujas da Eurásia, em várias regiões da Alemanha.

Até 2018, cinco linhagens de USUV estavam presentes na Alemanha (África 2, África 3, Europa 2, Europa 3 e Europa 5). O USUV também foi relatado em outros países europeus, como Tunísia, Marrocos, Israel, Grécia, França, Espanha, Polônia, Hungria, República Checa, Sérvia, Reino Unido, Croácia, Países Baixos, Suíça e Itália. Estudos filogenéticos revelaram a co-circulação de diferentes linhagens de USUV em vários países europeus.

No entanto, a circulação precisa do USUV na Alemanha ainda é pouco compreendida devido à falta de sequências completas do genoma do vírus. Para abordar essa lacuna, o sequenciamento Nanopore MinION foi utilizado para sequenciar 118 genomas de USUV de aves selvagens e em cativeiro na Alemanha de 2017 a 2021. O sequenciamento completo do genoma fornece um conjunto de dados mais abrangente e pode ajudar a elucidar a origem, as rotas de transmissão e a ecologia do USUV na Alemanha, bem como sua história evolutiva.

Este estudo oferece uma visão aprofundada sobre a evolução e propagação das principais linhagens do vírus Usutu (USUV) na Alemanha desde sua primeira detecção em 2010. Foi utilizada uma abordagem de sequenciamento de nanoporos para gerar sequências completas do genoma do USUV, permitindo uma análise filogenética detalhada.

O USUV tem sido uma causa contínua de doenças e mortes entre aves selvagens e em cativeiro na Alemanha desde 2011. A vigilância genômica regular do USUV é crucial para entender sua propagação e evolução. Este estudo demonstra que o sequenciamento de nanoporos é uma ferramenta sensível e eficaz para rastrear infecções contínuas por USUV em aves vivas e mortas. Além disso, a aplicação fácil e em tempo real dessa plataforma de sequenciamento a torna uma opção promissora para substituir o sequenciamento parcial no futuro.

A análise filogenética revelou a presença de várias linhagens de USUV na Alemanha, sendo as linhagens Europa 3 e África 3 as mais predominantes nos últimos anos (2017-2021). O estudo também sugere que houve atrasos de 1 a 3 anos entre a introdução de uma linhagem do USUV e sua detecção efetiva na Alemanha, destacando a importância de uma vigilância contínua e aprofundada.

Fatores climáticos, como temperaturas elevadas, foram identificados como facilitadores da propagação do USUV, especialmente durante as estações mais quentes. A análise também indica que diferentes linhagens de USUV podem persistir silenciosamente no ambiente antes de causar surtos com numerosas detecções, um fenômeno que pode ser influenciado por condições climáticas e fatores do hospedeiro e do vetor.

Em resumo, este estudo fornece informações valiosas sobre a dinâmica evolutiva e a propagação do USUV na Alemanha, destacando a importância da vigilância genômica contínua para monitorar e compreender as infecções por USUV em aves e outros hospedeiros. Além disso, os resultados podem ter implicações significativas para estratégias de saúde pública e intervenções para controlar a disseminação do USUV na população de aves e, potencialmente, em humanos.

📙 GLOSSÁRIO:

🖥️ FONTES :
Com Agências :
Bergmann F, Holicki CM, Michel F, Bock S, Scuda N, et al. (2023) Reconstruction of the molecular evolution of Usutu virus in Germany: Insights into virus emersion and circulation. PLOS Neglected Tropical Diseases 17(10): e0011203. https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011203
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