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Variantes do coronavírus sarscov-2 foram encontradas no esgoto semanas antes de aparecer nos testes Covid-19

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AR NEWS NOTÍCIAS   Brasil, Maceió 09 de julho de 2022

Uma técnica que detecta cepas de coronavírus circulando em uma comunidade pode se tornar um sistema de alerta precoce
Amostras de águas residuais podem ajudar a detectar precocemente novas variantes do SARS-CoV-2. Crédito: Arnold Jerocki/Getty
Amostras de águas residuais podem ajudar a detectar precocemente novas variantes do SARS-CoV-2. Crédito: Arnold Jerocki/Getty


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Pesquisadores na Califórnia retiraram uma grande quantidade de dados do lixo do banheiro. Pela primeira vez, os cientistas conseguiram detectar variantes específicas do SARS-CoV-2 no esgoto semanas antes de aparecerem nas clínicas de testes para covid.

Os dados de águas residuais rastrearam “onda após onda de diferentes vírus”, diz Rob Knight, microbiologista da Universidade da Califórnia, San Diego (UCSD), e coautor do estudo, publicado na Nature em 7 de julho. Knight diz que a técnica poderia eventualmente ser usada para rastrear variantes emergentes e acelerar a resposta da saúde pública. “Quando a próxima cepa chegar, estaremos prontos para isso.”

Grupos de pesquisa em todo o mundo usaram a vigilância de esgoto para rastrear o SARS-CoV-2, mas essas abordagens normalmente detectavam apenas a presença e a quantidade do vírus. Isso foi então usado para estimar a quantidade de transmissão em uma comunidade. Mas os esforços para identificar quais variantes estavam circulando e quão prevalentes eram foram atormentados por dados de baixa qualidade.

Para superar isso, a equipe da Califórnia desenvolveu um método que usa nanoesferas para aumentar a quantidade de RNA viral que pode ser sequenciado a partir de uma amostra de águas residuais. Técnicas anteriores permitiram aos cientistas sequenciar não mais que 40% do RNA viral em uma amostra, enquanto o método de nanoesferas permitiu que os pesquisadores sequenciassem quase 95%. A equipe da Califórnia também desenvolveu uma ferramenta, chamada Freyja, para identificar as variantes presentes em cada amostra e sua abundância relativa.

Amostras de esgoto

Para testar seus métodos, os cientistas passaram quase um ano coletando amostras de uma estação de tratamento de esgoto em San Diego que trata águas residuais de cerca de 2,3 milhões de pessoas. A coleta de dados começou em fevereiro de 2021. Eles também coletaram águas residuais de furos de manutenção e tubulações de esgoto em mais de 130 locais no campus da UCSD ao longo de 10 meses.

Os pesquisadores detectaram as variantes Alfa e Delta do coronavírus em águas residuais até duas semanas antes de as cepas serem detectadas por cotonetes e testes de pessoas em clínicas. Eles também detectaram o Omicron cerca de dez dias antes da primeira pessoa testar positivo para ele em San Diego e rastrearam o aumento da variante BA.1 do Omicron na população.

No campus da UCSD, os pesquisadores detectaram consistentemente Alpha, Delta e uma variante menos conhecida, Epsilon, encontrada principalmente nos Estados Unidos. Isso foi surpreendente porque houve semanas em que essas variantes quase desapareceram da vigilância clínica, diz o coautor Joshua Levy, matemático aplicado do Instituto de Pesquisa Scripps em La Jolla, Califórnia.

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Mas ainda não está claro se a técnica funcionará para rastrear as variantes Omicron BA.4 e BA.5 de rápida disseminação , que têm sido difíceis de distinguir umas das outras, diz Ana Maria de Roda Husman, pesquisadora de doenças infecciosas do Instituto Nacional Holandês de Saúde Pública e Meio Ambiente em Bilthoven.

E a perspectiva de um sistema de alerta precoce para variantes específicas ainda pode demorar um pouco, diz Phong Thai, cientista ambiental da Universidade de Queensland em Brisbane, Austrália, já que leva cerca de duas semanas para processar os resultados após a coleta. uma amostra. “Se você quer fazer uma ferramenta realmente útil para a saúde pública, ela tem que devolver o resultado em poucos dias”, diz Thai.

Mas Knight diz que a equipe conseguiu reduzir o tempo necessário para sequenciar amostras, de semanas para dias, o que é um “divisor de águas”

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