Em janeiro de 2020, a primeira sequência completa do genoma da síndrome respiratória aguda grave do coronavírus-2 (SARS-CoV-2) foi depositada no GenBank. Desde então, a quantidade de novas sequências de genoma aumentou rapidamente no GenBank e GISAID. Isso lançou as bases para a análise da virulência, antigenicidade, patogenicidade e transmissibilidade das mutações SARS-CoV-2.
Proteínas estruturais e não estruturais de SARS-CoV-2
O SARS-CoV-2 é um vírus de RNA de fita simples de sentido positivo que codifica 29 proteínas estruturais e não estruturais (NSPs) usando 29.903 nucleotídeos. As proteínas estruturais auxiliam na formação da partícula viral, enquanto os NSPs desempenham um papel significativo na replicação do RNA viral. O SARS-CoV-2 tem 4 proteínas estruturais, a saber, espícula (S), membrana (M), envelope (E) e proteínas do nucleocapsídeo (N).
Destes, a proteína spike (S) tem 1.273 resíduos de SARS-CoV-2 e tem um papel crítico na infecção viral. É essencial para a interação com os receptores da célula hospedeira e a fusão do envelope viral com a membrana da célula hospedeira para permitir a entrada do vírus. É também o local da maioria das mutações SARS-CoV-2. Conseqüentemente, os cientistas têm focado sua atenção na proteína Spike para desenvolver medicamentos e vacinas baseados em anticorpos.
Identificação de outras mutações de crescimento rápido na proteína SARS-CoV-2 spike (S)
As novas variantes do SARS-CoV-2 do Reino Unido, Brasil e África do Sul têm atraído muita atenção recentemente por sua maior infectividade, possivelmente alta patogenicidade e ameaças potenciais às vacinas e terapias baseadas em anticorpos disponíveis atualmente. No entanto, não está claro se existem mais variantes com maior infectividade que estão sendo transmitidas em todo o mundo.
Original: Por Susha Cheriyedath, M.Sc. medical net