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Nova linhagem de SARS-CoV-2 detectada em veados canadenses

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Uma investigação liderada por cientistas da Agência Canadense de Inspeção de Alimentos identificou uma linhagem nova e altamente divergente do SARS-CoV-2, o vírus que causa o COVID-19 em cervos de cauda branca (WTD) naquele país. As descobertas, que não são revisadas por pares, são publicadas como um estudo de pré-impressão no bioRxiv.
cervo
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A cepa divergente foi vista em amostras de cervos de Ontário que foram coletadas de 1º de novembro a 31 de dezembro de 2021, durante a temporada anual de caça. Os pesquisadores coletaram 213 swabs nasais e tecidos de 294 linfonodos retrofaríngeos. No geral, disseram os autores, o RNA do SARS-CoV-2 foi detectado em 21 amostras representando 6% (17/298) dos cervos colhidos por caçadores. Todos os cervos positivos eram do sudoeste de Ontário.

Usando amostras de zaragatoas nasais, os pesquisadores produziram 5 genomas de alta qualidade e 3 genomas parciais do vírus, e identificaram uma cepa altamente divergente que mais se assemelhava a sequências vistas em amostras humanas e de vison de Michigan coletadas em setembro e outubro de 2020; sudoeste de Ontário faz fronteira com Michigan.

"Este alto grau de divergência (e consequente longo ramo nas análises filogenéticas) é indicativo de um período de evolução viral não amostrada levando a 49 mutações em comparação com os genomas mais próximos", disseram os autores. “Isso é uma reminiscência do longo ramo e evolução viral que levou à variante Omicron, que recentemente foi associada a um possível reservatório de camundongo”.

Os autores dizem que não há evidências de contaminação de animais para humanos com essa cepa, mas dizem que isso pode ser possível.

“Neste momento, não há evidências de transmissão recorrente de veado para humano ou transmissão sustentada de humano para humano do clado Ontario WTD SARS-CoV-2”, escreveram os autores. "No entanto, o surgimento do Omicron e o fim da temporada de caça aos cervos significaram que os testes humanos e WTD e a vigilância genômica nesta região foram limitados desde que essas amostras foram coletadas".

O transbordamento entre espécies tem sido uma preocupação crescente entre pesquisadores de todo o mundo e foi documentado em martas e cervos na América do Norte. 
25 de fevereiro estudo
bioRxiv


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